همسانه‌سازی و بررسی فیلوژنتیکی توالی‌های دو ژن متعلق به زیر خانواده کریپتوکروم DASH جلبک Volvox carteri
نویسندگان
چکیده مقاله:
در اکثر موجودات، گیرنده های نوری پیام رسانی به منظور درک و تفسیر علائم محیطی به‌وجود آمده‌اند. این مولکول‌ها قادرند، نور را توسط کروموفورهای خود جذب کرده، مسیرهای پیام رسانی خاصی را در سلو‌ل‌ها به راه انداخته و سبب بروز پاسخ مناسب در سلول شوند. شاخه جدیدی از علم به نام اپتوژنتیک تلاش می‌کند تا از گیرنده های نوری به عنوان ابزارهای مولکولی جهت کنترل دقیق وقایع سلولی استفاده کند. یکی از راه‌های توسعه اپتوژنتیک، شناسایی ابزارهای مولکولی جدید دارای خصوصیات ویژه می باشد. بدین منظور تعیین خصوصیات ژنهای پیش گویی شده‌ای که اورتولوگ گیرنده های نوری شناسایی شده می باشند، بسیار مفید خواهد بود. در پروژه تعیین توالی ژنوم Volvox carteri دو ژن پیش‌گویی‌شده متعلق به خانواده‌ی Cryptochrome/Photolyase شناسایی شد. هدف از این مطالعه، جداسازی توالی‌های کدکنندهی این دو ژن، همسانه‌سازی دو ژن مذکور در داخل وکتور بیانی و تعیین موقعیت قالب خواندن باز آن‌ها در خانواده کریپتوکروم/فتولیاز می‌باشد. بدین منظور، جلبک V.carteri تحت شرایط بهینه رشد داده شد. سپس با استفاده از تکنیک RT-PCR توالی‌های کدکنندهی این دو ژن تکثیر شد. با استفاده از تکنیک مهندسی ژنتیک قطعات تکثیر شده وارد وکتور بیانی pGEX2TK گردید. به منظور همسانه‌سازی وکتور نوترکیب، پلاسمیدها وارد باکتری Escherichia coli گردیدند و سپس تعیین توالی شدند. نتیجه پژوهش نشان داد که توالی‌های ثبت‌شده در پایگاه داده‌ای NCBI به عنوان توالی mRNA برای دو ژن کریپتوکروم DASH، با توالی آن‌ها در ولوکس تفاوت هایی را نشان می دهد.
منابع مشابه
بررسی الگوی بیان ژن ویژه تیپ سلولی در جلبک Volvox carteri تحت شرایط تنش نوری
طول موجهای UV-B عمیق‌تر از هر طول موج دیگری به آب نفوذ می‌کنند. موجودات یوکاریوتی پیچیده از طریق بیان انتخابی بخش ویژه‌ای از ژنوم یکسان در انواع مختلف سلول، در پاسخ به نشانه‌های نموی و محیطی از قبیلUV-B تکامل یافته‌اند. تشکیل موجودات پرسلولی به مسیرهای سیگنالینگ ژنتیکی از پیش تعریف شده در انواع مختلف سلول نیاز دارد. انواع مختلف سلول باید بتوانند پاسخ‌های سازشی مناسب را نسبت به محیط در حال تغی...
متن کاملSexual Induction in Volvox Carteri
The study of the dependence of reactions on the concentration of various compounds is often of great value in determining reaction mechanisms . In chemical kinetics, it is often found that, according to van't Hoff's rule, the order of dependence of a reaction on the concentration of some compound involved in that reaction is equal to the number of molecules of the compound involved in each reac...
متن کاملبررسی بیان ژنهای گیرنده نوری و ژنهای هدف مسیر پاسخ به تابش UV-B در جلبک Volvox carteri
نور مهمترین منبع انرژی برای موجودات فتوسنتزی است. پروتئینهای گیرنده نور قادرند تا طول موجهای خاصی از نور را دریافت کرده و مسیر انتقال سیگنال را آغاز نمایند. Volvox carteri جلبک سبز پرسلولی ساده با داشتن ویژگیهای منحصربه فرد خود، بهعنوان مدل یوکاریوتی کمتر تکامل یافته برای مطالعه تکامل و توسعه گیرنده های نوری بسیار مناسب است. در پژوهش حاضر، اثر تابش (UV-B (0.056 mw.cm-2 بر بیان 13 ژن گیرن...
متن کاملTwo Different Rickettsial Bacteria Invading Volvox carteri
BACKGROUND Bacteria of the family Rickettsiaceae are principally associated with arthropods. Recently, endosymbionts of the Rickettsiaceae have been found in non-phagotrophic cells of the volvocalean green algae Carteria cerasiformis, Pleodorina japonica, and Volvox carteri. Such endosymbionts were present in only C. cerasiformis strain NIES-425 and V. carteri strain UTEX 2180, of various strai...
متن کاملA Preliminary Genetic Investigation of VOLVOX CARTERI.
A preliminary genetic analysis of a number of genetic variants of Volvox carteri f. nagariensis is presented. Techniques are outlined for mutagenesis of Volvox, isolation of mutants and routine genetic analysis. All of the mutants show simple Mendelian segregation patterns and have been tentatively placed in 14 linkage groups.
متن کاملFunctional analysis of the Volvox carteri asymmetric division protein GlsA
The Zuotin-family J protein chaperone GlsA is essential for the asymmetric divisions that establish germ and somatic cell initials during embryogenesis in the green alga Volvox carteri, but it is not known on what cellular process GlsA acts to carry out this function. Most GlsA protein is nuclear, and GlsA possesses two SANT domains, suggesting that GlsA may function as a transcriptional regula...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
عنوان ژورنال
دوره 33 شماره 2
صفحات 197- 206
تاریخ انتشار 2020-06-21
با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023